Công văn 6852/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành hướng dẫn giải quyết các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện thanh khoản hồ sơ nhập khẩu nguyên liệu, vật tư để sản xuất hàng xuất khẩu (SXXK). Đây là văn bản chỉ đạo nghiệp vụ quan trọng nhằm tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp và thống nhất quy trình xử lý của cơ quan hải quan địa phương đối với loại hình sản xuất xuất khẩu.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các Cục Hải quan tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương, các Chi cục Hải quan cửa khẩu và các doanh nghiệp thực hiện hoạt động nhập khẩu nguyên liệu, vật tư để sản xuất hàng hóa xuất khẩu đang gặp vướng mắc về thủ tục thanh khoản, hoàn thuế hoặc không thu thuế xuất nhập khẩu.

Nội dung hướng dẫn cốt lõi về thanh khoản hồ sơ nhập sản xuất xuất khẩu

- Nguyên tắc đối chiếu và xác định tính hợp lệ của hồ sơ thanh khoản

• Cơ quan hải quan thực hiện kiểm tra, đối chiếu chặt chẽ giữa lượng nguyên liệu, vật tư thực tế nhập khẩu với lượng sản phẩm thực tế xuất khẩu dựa trên định mức tiêu hao nguyên liệu đã đăng ký và báo cáo quyết toán của doanh nghiệp.
• Yêu cầu doanh nghiệp giải trình rõ ràng các trường hợp có sự chênh lệch bất thường giữa định mức lý thuyết và định mức thực tế sử dụng trong quá trình sản xuất trước khi chấp nhận thanh khoản.
• Các tờ khai hải quan dùng để thanh khoản phải đảm bảo tính hợp lệ, đã hoàn thành thủ tục thông quan đúng quy định và không nằm trong diện nghi vấn gian lận thương mại chưa được làm rõ.

- Xử lý thuế đối với nguyên liệu, vật tư dư thừa và phế liệu, phế phẩm

• Đối với lượng nguyên liệu, vật tư dư thừa sau chu kỳ sản xuất, nếu doanh nghiệp chuyển mục đích sử dụng sang tiêu thụ nội địa thì phải kê khai, nộp thuế nhập khẩu và thuế giá trị gia tăng theo quy định tại thời điểm chuyển mục đích sử dụng.
• Đối với phế liệu, phế phẩm thu được trong quá trình sản xuất hàng xuất khẩu từ nguồn nguyên liệu nhập khẩu: Doanh nghiệp được miễn thuế nhập khẩu đối với phần phế liệu, phế phẩm nằm trong định mức hao hụt tự nhiên. Trường hợp bán thanh lý ra thị trường nội địa thì phải kê khai nộp thuế giá trị gia tăng và các loại thuế liên quan khác theo quy định của pháp luật thuế nội địa.

- Giải quyết vướng mắc về thời hạn nộp hồ sơ thanh khoản và xử lý chậm nộp

• Tổng cục Hải quan hướng dẫn cụ thể việc xử lý đối với các trường hợp doanh nghiệp nộp hồ sơ thanh khoản quá thời hạn quy định do nguyên nhân khách quan như thiên tai, dịch bệnh, đối tác nước ngoài chậm thanh toán hoặc gặp sự cố hệ thống thông tin dữ liệu.
• Xem xét không xử phạt vi phạm hành chính đối với các trường hợp chậm nộp có lý do bất khả kháng được xác nhận hợp pháp, đồng thời tạo điều kiện để doanh nghiệp hoàn thiện hồ sơ hoàn thuế, không thu thuế nhanh chóng.
• Đối với các trường hợp cố tình trì hoãn hoặc không nộp hồ sơ thanh khoản đúng hạn mà không có lý do chính đáng, cơ quan hải quan sẽ tiến hành ấn định thuế và xử lý vi phạm theo đúng quy định của Luật Quản lý thuế.

- Quy trình phối hợp xác minh giữa các đơn vị hải quan

• Tăng cường sự phối hợp chặt chẽ giữa Chi cục Hải quan nơi doanh nghiệp làm thủ tục nhập khẩu nguyên liệu và Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục xuất khẩu sản phẩm để xác minh tính thực xuất của hàng hóa.
• Trong trường hợp phát hiện dấu hiệu nghi ngờ về tính trung thực của hồ sơ thanh khoản, Chi cục Hải quan thụ lý hồ sơ phải chủ động gửi phiếu yêu cầu xác minh đến các đơn vị liên quan và phản hồi kết quả trong thời hạn quy định để không làm ảnh hưởng đến tiến độ hoàn thuế của doanh nghiệp.

Hiệu lực thi hành

Công văn 6852/TCHQ-KTTT có hiệu lực hướng dẫn kể từ ngày ban hành. Các nội dung hướng dẫn tại văn bản này được áp dụng thống nhất cho các hồ sơ thanh khoản còn tồn đọng hoặc phát sinh vướng mắc tương tự tại thời điểm văn bản có hiệu lực, góp phần chuẩn hóa quy trình quản lý thuế và hải quan đối với loại hình sản xuất xuất khẩu.