Tóm tắt Công văn 6672/TCHQ-TXNK năm 2019 về hoàn thuế nộp thừa đối với hàng hóa nhập khẩu

Công văn 6672/TCHQ-TXNK do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm hướng dẫn các Cục Hải quan tỉnh, thành phố thực hiện thống nhất việc xử lý tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu. Văn bản này đóng vai trò quan trọng trong việc tháo gỡ vướng mắc cho doanh nghiệp, đảm bảo tính minh bạch và tuân thủ đúng quy định của Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành.

- Các trường hợp được xác định là tiền thuế nộp thừa

Theo hướng dẫn tại công văn, tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt được coi là nộp thừa khi thuộc một trong các trường hợp sau:

• Người nộp thuế có số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt đã nộp lớn hơn số tiền phải nộp đối với từng loại thuế trong thời hạn 05 năm kể từ ngày nộp tiền vào ngân sách nhà nước.
• Phát sinh do người nộp thuế khai sai, nhầm lẫn khi khai báo hải quan nhưng đã tự phát hiện và khai bổ sung, hoặc do cơ quan hải quan ấn định thuế sau khi thanh tra, kiểm tra.
• Hàng hóa nhập khẩu đã nộp thuế nhưng thực tế không nhập khẩu hoặc nhập khẩu ít hơn so với khai báo.
• Hàng hóa nhập khẩu phải tái xuất trả lại chủ hàng nước ngoài, tái xuất sang nước thứ ba hoặc xuất khẩu vào khu phi thuế quan và đã thực tế xuất khẩu.

- Nguyên tắc và thẩm quyền hoàn trả tiền thuế nộp thừa

Việc hoàn trả tiền thuế nộp thừa được thực hiện theo các nguyên tắc chặt chẽ nhằm bảo đảm quản lý ngân sách nhà nước:

• Cơ quan hải quan nơi phát sinh khoản tiền thuế nộp thừa có thẩm quyền tiếp nhận hồ sơ, kiểm tra đối chiếu số liệu trên hệ thống kế toán thuế tập trung để ban hành quyết định hoàn thuế.
• Khoản tiền thuế nộp thừa được xử lý theo thứ tự ưu tiên: Bù trừ vào số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt còn nợ của người nộp thuế; bù trừ vào số thuế phải nộp của kỳ tiếp theo; hoặc hoàn trả trực tiếp vào tài khoản của doanh nghiệp nếu không còn nợ thuế.

- Hướng dẫn xử lý thuế Giá trị gia tăng (GTGT) nộp thừa ở khâu nhập khẩu

Đây là nội dung cốt lõi và thường phát sinh vướng mắc nhất giữa cơ quan hải quan, cơ quan thuế và doanh nghiệp. Công văn hướng dẫn cụ thể:

• Trường hợp người nộp thuế nộp thừa thuế GTGT ở khâu nhập khẩu nhưng chưa kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào với cơ quan thuế nội địa: Cơ quan hải quan thực hiện hoàn trả trực tiếp cho doanh nghiệp theo quy định.
• Trường hợp người nộp thuế đã thực hiện kê khai, khấu trừ hoặc hoàn thuế GTGT đầu vào tại cơ quan thuế nội địa: Cơ quan hải quan không thực hiện hoàn trả trực tiếp số thuế GTGT nộp thừa này. Thay vào đó, cơ quan hải quan sẽ thực hiện xác nhận số thuế nộp thừa và phối hợp, chuyển thông tin sang cơ quan thuế nội địa để xử lý theo quy định của pháp luật về thuế GTGT.
• Doanh nghiệp có nghĩa vụ tự kê khai, cam kết và chịu trách nhiệm trước pháp luật về tình trạng kê khai, khấu trừ thuế GTGT đối với lô hàng yêu cầu hoàn thuế để làm cơ sở cho cơ quan hải quan giải quyết.

- Trách nhiệm triển khai của cơ quan hải quan các cấp

Để đảm bảo việc thực thi hiệu quả, Tổng cục Hải quan yêu cầu các đơn vị hải quan địa phương:

• Tăng cường công tác kiểm tra, đối chiếu hồ sơ hoàn thuế nhằm ngăn chặn các hành vi gian lận, hoàn trùng hoặc trục lợi tiền thuế từ ngân sách nhà nước.
• Cập nhật đầy đủ, kịp thời thông tin về các quyết định hoàn thuế, bù trừ thuế lên hệ thống quản lý thuế tập trung của ngành Hải quan để đảm bảo tính đồng bộ dữ liệu.
• Chủ động phối hợp chặt chẽ với cơ quan thuế nội địa trên địa bàn để xác minh thông tin khấu trừ thuế GTGT của doanh nghiệp trước khi quyết định hoàn thuế.