Công văn 6649/TCHQ-TXNK do Tổng cục Hải quan ban hành nhằm kịp thời tháo gỡ các vướng mắc, khó khăn phát sinh trong quá trình triển khai thực hiện Nghị định số 87/2010/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Thuế xuất khẩu, Thuế nhập khẩu. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng, giúp thống nhất quy trình thực hiện thủ tục hải quan và áp dụng chính sách thuế trên phạm vi toàn quốc.

Phạm vi áp dụng và đối tượng chịu sự tác động

Văn bản hướng dẫn trực tiếp đến các Cục Hải quan tỉnh, thành phố trong việc thực thi công vụ. Đồng thời, đối tượng áp dụng bao gồm các tổ chức, cá nhân, doanh nghiệp tham gia hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu có vướng mắc liên quan đến các chính sách ưu đãi thuế, miễn thuế, giảm thuế và hoàn thuế theo quy định tại Nghị định số 87/2010/NĐ-CP.

Nội dung hướng dẫn xử lý vướng mắc về miễn thuế đối với dự án ưu đãi đầu tư

• Xác định đối tượng miễn thuế tạo tài sản cố định: Tổng cục Hải quan hướng dẫn chi tiết việc phân loại và áp dụng miễn thuế nhập khẩu đối với máy móc, thiết bị, phương tiện vận tải chuyên dùng nằm trong dây chuyền công nghệ nhập khẩu để tạo tài sản cố định của dự án khuyến khích đầu tư.
• Thủ tục đăng ký Danh mục hàng hóa miễn thuế: Làm rõ quy trình, thời hạn và hồ sơ đăng ký Danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế trước khi làm thủ tục nhập khẩu lô hàng đầu tiên. Hướng dẫn cơ quan hải quan địa phương cách thức tiếp nhận, kiểm tra và theo dõi trừ lùi hàng hóa thực tế nhập khẩu.
• Xử lý đối với trường hợp chuyển nhượng dự án: Quy định cụ thể nghĩa vụ thuế và thủ tục hải quan khi doanh nghiệp chuyển nhượng tài sản cố định đã được miễn thuế nhập khẩu cho dự án khác hoặc thay đổi mục đích sử dụng ban đầu.

Chính sách miễn thuế đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất

• Điều kiện áp dụng miễn thuế: Hướng dẫn chi tiết về việc miễn thuế nhập khẩu trong thời hạn 05 năm kể từ ngày bắt đầu sản xuất đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong nước chưa sản xuất được, nhập khẩu để phục vụ sản xuất của các dự án thuộc danh mục đặc biệt khuyến khích đầu tư hoặc địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn.
• Tiêu chí xác định hàng hóa trong nước chưa sản xuất được: Căn cứ vào danh mục do Bộ Kế hoạch và Đầu tư ban hành để làm cơ sở đối chiếu, áp dụng chính sách thuế chính xác, tránh thất thu ngân sách nhà nước nhưng vẫn đảm bảo quyền lợi hợp pháp của doanh nghiệp.

Thủ tục hoàn thuế, không thu thuế và giải quyết hồ sơ tồn đọng

• Hồ sơ hoàn thuế đối với hàng hóa tái xuất: Hướng dẫn cụ thể về chứng từ, hồ sơ cần thiết để thực hiện hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa đã nhập khẩu nhưng phải tái xuất trả lại chủ hàng nước ngoài hoặc tái xuất sang nước thứ ba.
• Thời hạn giải quyết và quy trình kiểm tra: Quy định rõ thời hạn thẩm định hồ sơ hoàn thuế, không thu thuế tại cơ quan hải quan các cấp nhằm rút ngắn thời gian thông quan, giảm thiểu chi phí hành chính cho doanh nghiệp.
• Xử lý nợ thuế và phạt chậm nộp: Hướng dẫn phân loại các khoản nợ thuế phát sinh do hiểu sai quy định giữa văn bản cũ và mới, đưa ra phương án xử lý giãn nợ hoặc không tính phạt chậm nộp đối với các trường hợp bất khả kháng hoặc do lỗi khách quan từ hệ thống pháp luật.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Công văn 6649/TCHQ-TXNK có hiệu lực hướng dẫn thực hiện ngay từ ngày ban hành, đồng hành cùng quá trình áp dụng Nghị định 87/2010/NĐ-CP. Tổng cục Hải quan yêu cầu các Cục Hải quan địa phương quán triệt nội dung hướng dẫn đến từng cán bộ, công chức hải quan trực tiếp làm thủ tục; đồng thời chủ động tuyên truyền, phổ biến rộng rãi đến cộng đồng doanh nghiệp trên địa bàn để nghiêm túc thực hiện, đảm bảo tính thống nhất và minh bạch của pháp luật hải quan.