Công văn 6043/TCHQ-TXNK được ban hành bởi Tổng cục Hải quan nhằm hướng dẫn chi tiết về thủ tục hoàn thuế, không thu thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu. Đây là văn bản quan trọng giúp thống nhất quy trình thực hiện trong toàn ngành Hải quan, tháo gỡ các vướng mắc cho doanh nghiệp và cơ quan hải quan địa phương trong quá trình thực thi pháp luật thuế đối với hàng hóa xuất nhập khẩu.

1. Mục đích và phạm vi áp dụng của văn bản

Công văn hướng dẫn các Cục Hải quan tỉnh, thành phố thực hiện thống nhất các quy định về thủ tục hồ sơ hoàn thuế, không thu thuế theo quy định của Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành tại thời điểm ban hành. Đối tượng áp dụng bao gồm cơ quan hải quan các cấp và các tổ chức, cá nhân có hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu thuộc đối tượng được hoàn thuế, không thu thuế.

2. Các nội dung trọng tâm về thủ tục hoàn thuế

• Hồ sơ hoàn thuế, không thu thuế: Hướng dẫn chi tiết về các loại giấy tờ, chứng từ mà người nộp thuế phải nộp hoặc xuất trình cho cơ quan hải quan. Quy định rõ tính hợp lệ, hợp pháp của chứng từ thanh toán qua ngân hàng, tờ khai hải quan và các tài liệu liên quan để chứng minh hàng hóa thực tế xuất khẩu hoặc nhập khẩu.
• Quy trình tiếp nhận và xử lý hồ sơ: Phân định rõ trách nhiệm của từng bộ phận trong cơ quan hải quan từ khâu tiếp nhận hồ sơ, kiểm tra tính đầy đủ, hợp lệ đến khâu thẩm định và ra quyết định hoàn thuế hoặc không thu thuế cho doanh nghiệp.
• Thời hạn giải quyết: Nhấn mạnh việc tuân thủ nghiêm ngặt thời hạn giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định của pháp luật nhằm bảo đảm quyền lợi chính đáng của doanh nghiệp, tránh gây chậm trễ, phiền hà trong hoạt động sản xuất kinh doanh.

3. Hướng dẫn xử lý một số trường hợp cụ thể

• Hàng hóa nhập khẩu nhưng phải tái xuất: Hướng dẫn cụ thể về điều kiện và thủ tục hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa đã nộp thuế nhập khẩu nhưng sau đó phải tái xuất trả lại chủ hàng nước ngoài, tái xuất sang nước thứ ba hoặc tái xuất vào khu phi thuế quan.
• Hàng hóa nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu: Quy định về việc kiểm tra cơ sở sản xuất, năng lực sản xuất và việc quyết toán tình hình sử dụng nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu làm cơ sở cho việc hoàn thuế, không thu thuế.
• Xử lý tiền thuế nộp thừa: Hướng dẫn thủ tục hoàn trả hoặc bù trừ số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa của doanh nghiệp vào các kỳ nộp thuế tiếp theo theo đúng quy định pháp luật.

4. Tổ chức thực hiện và trách nhiệm của cơ quan hải quan

• Tăng cường công tác kiểm tra, giám sát: Yêu cầu các Cục Hải quan địa phương nâng cao trách nhiệm trong việc kiểm tra hồ sơ, đối chiếu thực tế để ngăn chặn các hành vi gian lận thương mại, khai sai lệch thông tin nhằm trục lợi chính sách hoàn thuế của Nhà nước.
• Hỗ trợ và giải đáp vướng mắc: Cơ quan hải quan có trách nhiệm tuyên truyền, hướng dẫn và giải đáp kịp thời các khó khăn, vướng mắc phát sinh của doanh nghiệp trong quá trình thực hiện thủ tục hoàn thuế, đảm bảo môi trường kinh doanh minh bạch, thuận lợi.