Công văn 5762/TCHQ-KTTT được Tổng cục Hải quan ban hành ngày 27 tháng 09 năm 2021 nhằm tháo gỡ các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện thủ tục hoàn thuế, miễn thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu. Văn bản tập trung hướng dẫn các đơn vị hải quan địa phương thống nhất thực hiện các quy định pháp luật về thuế, đặc biệt là các nội dung mới liên quan đến Nghị định 18/2021/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung Nghị định 134/2016/NĐ-CP.

Phạm vi và đối tượng áp dụng

Văn bản áp dụng đối với các Cục Hải quan tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương, các chi cục hải quan cửa khẩu và các doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân có hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu gặp vướng mắc về thủ tục hoàn thuế nhập khẩu, thuế giá trị gia tăng (VAT) đối với nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu hoặc hàng hóa tái xuất.

Xử lý thuế đối với nguyên liệu nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu

• Tổng cục Hải quan hướng dẫn chi tiết về điều kiện để được miễn thuế, hoàn thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu, vật tư nhập khẩu phục vụ hoạt động sản xuất xuất khẩu. Doanh nghiệp phải chứng minh được quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng hợp pháp đối với cơ sở sản xuất, máy móc thiết bị trên lãnh thổ Việt Nam.
• Trường hợp doanh nghiệp nhập khẩu nguyên liệu để sản xuất xuất khẩu nhưng sau đó không sử dụng vào sản xuất mà chuyển mục đích sử dụng, tiêu thụ nội địa hoặc tiêu hủy thì phải thực hiện kê khai tờ khai hải quan mới, nộp đủ thuế nhập khẩu và các loại thuế liên quan theo quy định tại thời điểm thay đổi mục đích sử dụng.
• Đối với lượng phế liệu, phế phẩm thu được trong quá trình sản xuất hàng xuất khẩu từ nguyên liệu nhập khẩu, khi bán ra thị trường nội địa được miễn thuế nhập khẩu nhưng doanh nghiệp phải kê khai, nộp thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định của pháp luật thuế nội địa.

Thủ tục hoàn thuế đối với hoạt động xuất khẩu tại chỗ

• Văn bản làm rõ quy trình xử lý thuế đối với sản phẩm xuất khẩu tại chỗ. Để được hoàn thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu cấu thành nên sản phẩm xuất khẩu tại chỗ, doanh nghiệp xuất khẩu phải cung cấp đầy đủ chứng từ chứng minh hàng hóa đã được giao nhận thực tế giữa các bên.
• Hồ sơ hoàn thuế bắt buộc phải có tờ khai hải quan xuất khẩu tại chỗ và tờ khai hải quan nhập khẩu tại chỗ đối ứng đã được thông quan hoàn toàn.
• Doanh nghiệp phải xuất trình chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt qua ngân hàng đối với giao dịch xuất khẩu tại chỗ. Các trường hợp thanh toán không đúng quy định hoặc không có chứng từ thanh toán hợp lệ sẽ không đủ điều kiện để được xem xét hoàn thuế.

Hồ sơ, thủ tục và trách nhiệm của người nộp thuế

• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự xác định, tự khai báo định mức thực tế sử dụng để sản xuất sản phẩm xuất khẩu và chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác, trung thực của số liệu định mức đã khai báo với cơ quan hải quan.
• Hồ sơ đề nghị hoàn thuế phải được nộp đúng thời hạn quy định. Cơ quan hải quan thực hiện phân loại hồ sơ hoàn thuế theo nguyên tắc quản lý rủi ro: thực hiện "hoàn thuế trước, kiểm tra sau" đối với doanh nghiệp ưu tiên, doanh nghiệp tự nguyện tuân thủ tốt pháp luật; và "kiểm tra trước, hoàn thuế sau" đối với các trường hợp có dấu hiệu rủi ro cao hoặc doanh nghiệp có lịch sử vi phạm pháp luật về thuế, hải quan.
• Cơ quan hải quan tăng cường công tác kiểm tra sau thông quan đối với các hồ sơ hoàn thuế đã được xử lý nhằm kịp thời phát hiện, ngăn chặn và xử lý nghiêm các hành vi gian lận, trục lợi tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Xử lý tiền thuế giá trị gia tăng (VAT) nộp thừa

• Đối với số thuế giá trị gia tăng phát sinh nộp thừa do doanh nghiệp nộp nhầm hoặc do thay đổi loại hình, mục đích sử dụng hàng hóa, Tổng cục Hải quan hướng dẫn quy trình phối hợp giữa cơ quan hải quan và cơ quan thuế địa phương để thực hiện hoàn trả cho doanh nghiệp.
• Việc hoàn trả tiền thuế VAT nộp thừa phải đảm bảo nguyên tắc không hoàn trùng, không làm thất thoát ngân sách và phải được thực hiện nhanh chóng nhằm hỗ trợ dòng vốn cho doanh nghiệp phục hồi sản xuất, kinh doanh.

Hiệu lực thi hành và tổ chức thực hiện

Công văn 5762/TCHQ-KTTT có hiệu lực hướng dẫn thực hiện ngay từ ngày ban hành. Tổng cục Hải quan yêu cầu các Cục Hải quan tỉnh, thành phố quán triệt nội dung văn bản đến toàn thể cán bộ, công chức hải quan làm công tác quản lý thuế; đồng thời chủ động tuyên truyền, hướng dẫn doanh nghiệp trên địa bàn thực hiện đúng quy định, tránh phát sinh nợ đọng thuế hoặc khiếu nại kéo dài.