Công văn 5199/TCT-KK được Tổng cục Thuế ban hành năm 2014 nhằm hướng dẫn và chấn chỉnh công tác quản lý hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT). Đây là văn bản chỉ đạo nghiệp vụ quan trọng giúp các cơ quan thuế địa phương thống nhất quy trình kiểm tra, phân loại hồ sơ hoàn thuế và ngăn chặn các hành vi gian lận hoàn thuế GTGT.

Phân loại và xử lý hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng

Công văn hướng dẫn chi tiết việc phân loại hồ sơ hoàn thuế nhằm đảm bảo tính chính xác và hạn chế tối đa rủi ro thất thoát ngân sách nhà nước:

• Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau: Áp dụng đối với các doanh nghiệp có lịch sử tuân thủ pháp luật thuế tốt, không thuộc nhóm đối tượng rủi ro cao. Cơ quan thuế thực hiện hoàn thuế nhanh chóng theo đúng thời hạn quy định, sau đó tiến hành thanh tra, kiểm tra theo kế hoạch hậu kiểm.
• Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau: Áp dụng bắt buộc đối với các doanh nghiệp có dấu hiệu rủi ro cao về thuế, doanh nghiệp mới thành lập dưới 12 tháng, doanh nghiệp có giao dịch đáng ngờ hoặc sử dụng hóa đơn của các doanh nghiệp đã bỏ trốn, giải thể.

Công tác kiểm tra, xác minh hóa đơn mua vào

Để ngăn chặn tình trạng sử dụng hóa đơn bất hợp pháp nhằm khấu trừ và hoàn thuế trái quy định, Tổng cục Thuế yêu cầu:

• Xác minh nguồn gốc hàng hóa, dịch vụ: Cơ quan thuế phải thực hiện đối chiếu, xác minh kỹ lưỡng hóa đơn mua vào của doanh nghiệp đề nghị hoàn thuế. Đặc biệt lưu ý các hóa đơn có giá trị lớn hoặc mua từ các doanh nghiệp ở địa phương khác.
• Xử lý đối với hóa đơn của doanh nghiệp bỏ trốn: Trường hợp phát hiện doanh nghiệp bán hàng đã bỏ trốn hoặc ngừng hoạt động, cơ quan thuế phải tạm dừng hoàn thuế đối với số thuế GTGT đầu vào tương ứng để thực hiện xác minh làm rõ bản chất giao dịch.
• Phối hợp liên ngành: Tăng cường phối hợp chặt chẽ với cơ quan Công an và các cơ quan chức năng khác để điều tra, xử lý nghiêm các trường hợp có dấu hiệu lừa đảo, mua bán hóa đơn bất hợp pháp nhằm chiếm đoạt tiền hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

Trách nhiệm của cơ quan thuế và công chức thuế

Văn bản nhấn mạnh vai trò và trách nhiệm của cán bộ, công chức trong quá trình tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế:

• Đảm bảo thời hạn giải quyết: Cơ quan thuế phải giải quyết hồ sơ hoàn thuế đúng thời hạn quy định của pháp luật, không được kéo dài thời gian vô lý gây khó khăn cho hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp tuân thủ tốt.
• Nâng cao trách nhiệm kiểm tra: Công chức thuế được giao nhiệm vụ kiểm tra hồ sơ hoàn thuế phải chịu trách nhiệm về tính đầy đủ, hợp pháp của các thủ tục và kết quả kiểm tra, xác minh.
• Xử lý nghiêm vi phạm: Nghiêm cấm các hành vi nhũng nhiễu, gây phiền hà cho người nộp thuế hoặc cố ý bao che, thông đồng cho các hành vi gian lận thuế.