Tổng cục Thuế nhận được công văn số 51-12/CV-TD ngày 2/10/2012 của Công ty TNHH Thiên Dược về chính sách thuế thu nhập doanh nghiệp. Về vấn đề này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Nghị định số 124/2008/NĐ-CP ngày 11/12/2008, Nghị định số 122/2011/NĐ-CP ngày 27/12/2011 của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp quy định thuế suất ưu đãi và miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp thuộc lĩnh vực công nghệ cao, nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ.

Tại Khoản 5 Điều 1 và khoản 3 Điều 2 Nghị định số 96/2010/NĐ-CP ngày 20/9/2010 của Chính phủ sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định số 115/2005/NĐ-CP ngày 5/9/2005 của Chính phủ quy định cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm của tổ chức khoa học và công nghệ công lập và nghị định số 80/2007/NĐ-CP ngày 19/5/2007 của Chính phủ về doanh nghiệp khoa học và công nghệ quy định:

"5. Được hưởng thuế suất ưu đãi, miễn thuế, giảm thuế như đối với doanh nghiệp khoa học và công nghệ."

"2. Được miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp như doanh nghiệp thành lập mới từ dự án đầu tư thuộc lĩnh vực công nghệ cao, nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ kể từ khi có thu nhập chịu thuế với điều kiện: doanh thu của các sản phẩm, hàng hóa hình thành từ kết quả khoa học và công nghệ trong năm thứ nhất từ 30% tổng doanh thu trở lên, năm thứ hai từ 50% tổng doanh thu trở lên và năm thứ ba trở đi từ 70% tổng doanh thu trở lên của doanh nghiệp khoa học và công nghệ.

Doanh nghiệp khoa học và công nghệ không được miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp đối với năm tài chính không đáp ứng được điều kiện về tỷ lệ doanh thu nêu trên."

Hiện nay, Bộ Tài chính, Bộ Khoa học và Công nghệ và Bộ Nội vụ đang xây dựng thông tư liên tịch để hướng dẫn Nghị định số 96/2010/NĐ-CP và 80/2007/NĐ-CP nêu trên. Theo đó, nếu Công ty TNHH Thiên Dược được chứng nhận là doanh nghiệp khoa học công nghệ theo quy định tại Nghị định số 96/2010/NĐ-CP và 80/2007/NĐ-CP nêu trên thì được hưởng chế độ miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp như doanh nghiệp mới thành lập từ dự án đầu tư thuộc lĩnh vực công nghệ cao, nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ kể từ khi có thu nhập chịu thuế với điều kiện: doanh nghiệp khoa học công nghệ có tỷ lệ doanh thu từ việc sản xuất, kinh doanh các sản phẩm, hàng hóa hình thành từ kết quả khoa học và công nghệ trên tổng doanh thu của doanh nghiệp (sau đây viết tắt là tỷ lệ doanh thu) trong năm thứ nhất từ 30% trở lên, năm thứ hai từ 50% trở lên và năm thứ ba trở đi từ 70% trở lên. Năm thứ nhất được hiểu là năm đầu tiên doanh nghiệp KH&CN có thu nhập chịu thuế.

Đề nghị Công ty TNHH Thiên Dược căn cứ vào tình hình thực tế và quy định của pháp luật để thực hiện theo quy định của pháp luật.

Tổng cục Thuế trả lời để Công ty được biết.