Công văn 4401/CT-TTHT do Cục Thuế thành phố Hồ Chí Minh ban hành năm 2016 hướng dẫn chi tiết về việc lập hóa đơn và kê khai nộp thuế đối với hoạt động cho thuê lại nhà xưởng của doanh nghiệp. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp các tổ chức, doanh nghiệp thực hiện đúng nghĩa vụ thuế khi phát sinh hoạt động cho thuê lại tài sản, tránh các rủi ro pháp lý về hóa đơn và thuế.

Quy định về lập hóa đơn khi cho thuê lại nhà xưởng

• Thời điểm lập hóa đơn: Doanh nghiệp thực hiện cho thuê lại nhà xưởng phải lập hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT) khi thu tiền hoặc theo kỳ hạn thanh toán được thỏa thuận cụ thể trong hợp đồng thuê.
• Loại hóa đơn sử dụng: Sử dụng hóa đơn GTGT với thuế suất thuế GTGT thông thường là 10% đối với hoạt động dịch vụ cho thuê tài sản, nhà xưởng.
• Nội dung trên hóa đơn: Hóa đơn phải thể hiện rõ ràng tên dịch vụ (cho thuê lại nhà xưởng), kỳ thanh toán, đơn giá và tổng số tiền thanh toán đã bao gồm hoặc chưa bao gồm thuế GTGT theo đúng thỏa thuận trong hợp đồng.

Kê khai và nộp thuế giá trị gia tăng (GTGT)

• Phương pháp kê khai: Doanh nghiệp kê khai thuế GTGT đầu ra đối với doanh thu cho thuê lại nhà xưởng theo phương pháp khấu trừ (nếu doanh nghiệp áp dụng phương pháp khấu trừ) hoặc theo tỷ lệ trên doanh thu (nếu áp dụng phương pháp trực tiếp).
• Khấu trừ thuế đầu vào: Doanh nghiệp được khấu trừ thuế GTGT đầu vào của các chi phí liên quan trực tiếp đến hoạt động cho thuê lại nhà xưởng (như chi phí sửa chữa, bảo dưỡng, điện nước nếu có hóa đơn chứng từ hợp lệ) nếu đáp ứng đủ điều kiện khấu trừ theo quy định hiện hành.

Kê khai và nộp thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN)

• Xác định doanh thu tính thuế TNDN: Doanh thu từ hoạt động cho thuê lại nhà xưởng là toàn bộ tiền thuê nhận được theo hợp đồng. Trường hợp bên thuê trả tiền trước cho nhiều năm thì doanh nghiệp có thể lựa chọn phân bổ doanh thu theo số năm trả trước hoặc xác định doanh thu tính thuế TNDN một lần theo số tiền nhận trước.
• Xác định chi phí được trừ: Doanh nghiệp được tính vào chi phí được trừ các khoản chi phí thực tế phát sinh liên quan đến nhà xưởng cho thuê như chi phí khấu hao (nếu có quyền khấu hao), chi phí sửa chữa, tiền thuê đất trả cho nhà nước hoặc bên thứ nhất, và các chi phí quản lý liên quan trực tiếp khác.
• Thuế suất thuế TNDN: Thu nhập từ hoạt động cho thuê lại nhà xưởng được gộp chung vào thu nhập chịu thuế từ hoạt động sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp để áp dụng mức thuế suất thuế TNDN phổ thông (thông thường là 20%).

Lưu ý đối với hoạt động cho thuê lại đất và tài sản gắn liền với đất

• Điều kiện cho thuê lại: Doanh nghiệp phải đảm bảo có chức năng kinh doanh bất động sản hoặc hoạt động cho thuê tài sản được đăng ký hợp pháp theo quy định của Luật Doanh nghiệp và Luật Kinh doanh bất động sản.
• Nghĩa vụ tài chính với Nhà nước: Doanh nghiệp cần rà soát nghĩa vụ tiền thuê đất đối với Nhà nước (thuê đất trả tiền hàng năm hoặc trả tiền một lần) để thực hiện đúng quyền và nghĩa vụ cho thuê lại theo quy định của Luật Đất đai.