Công văn 41661/CT-TTHT do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành năm 2019 hướng dẫn chi tiết về việc khai thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với chi nhánh của doanh nghiệp. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp các doanh nghiệp xác định đúng nghĩa vụ và địa điểm kê khai thuế GTGT cho các đơn vị phụ thuộc, đảm bảo tuân thủ đúng quy định của pháp luật thuế hiện hành.

Khai thuế GTGT đối với chi nhánh cùng tỉnh, thành phố với trụ sở chính

Đối với các chi nhánh, đơn vị trực thuộc hạch toán phụ thuộc nằm trên cùng địa bàn tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương với trụ sở chính, việc kê khai thuế được thực hiện theo các nguyên tắc sau:

• Theo nguyên tắc chung, người nộp thuế (trụ sở chính) sẽ thực hiện khai thuế GTGT chung cho cả phần hoạt động sản xuất kinh doanh của chi nhánh trực thuộc.
• Trường hợp chi nhánh trực thuộc có con dấu riêng, tài khoản tiền gửi ngân hàng riêng, trực tiếp bán hàng hóa, dịch vụ, kê khai đầy đủ thuế GTGT đầu vào, đầu ra và có nhu cầu kê khai nộp thuế riêng thì được phép đăng ký thuế để cấp mã số thuế đơn vị trực thuộc và thực hiện khai, nộp thuế GTGT riêng với cơ quan thuế quản lý trực tiếp chi nhánh.

Khai thuế GTGT đối với chi nhánh khác tỉnh, thành phố với trụ sở chính

Đối với các chi nhánh hạch toán phụ thuộc nằm ở tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương khác với nơi đặt trụ sở chính của doanh nghiệp, quy định kê khai thuế được phân định rõ ràng:

• Chi nhánh có nghĩa vụ nộp hồ sơ khai thuế GTGT cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp của chi nhánh tại địa phương nơi chi nhánh đóng trụ sở.
• Trường hợp chi nhánh không trực tiếp bán hàng, không phát sinh doanh thu thì thực hiện khai thuế tập trung tại trụ sở chính của người nộp thuế.
• Đối với các dự án đầu tư của chi nhánh tại địa phương khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, doanh nghiệp phải lập hồ sơ khai thuế GTGT riêng cho dự án đầu tư và nộp cho cơ quan thuế nơi có dự án đầu tư.

Nguyên tắc sử dụng hóa đơn và hạch toán kế toán tại chi nhánh

Để đảm bảo tính hợp pháp khi thực hiện kê khai thuế GTGT riêng biệt hoặc tập trung, doanh nghiệp cần lưu ý các nguyên tắc về chứng từ và hạch toán:

• Hóa đơn mua vào, bán ra của chi nhánh phải mang tên, địa chỉ và mã số thuế của chi nhánh (đối với trường hợp chi nhánh kê khai riêng) hoặc phải tuân thủ đúng quy định về ủy quyền xuất hóa đơn theo quy định của Bộ Tài chính.
• Việc phân bổ số thuế GTGT phải nộp (nếu có) giữa trụ sở chính và các chi nhánh khác tỉnh phải tuân thủ đúng tỷ lệ và phương pháp hướng dẫn tại các văn bản quy phạm pháp luật về quản lý thuế hiện hành.