Tổng quan về Công văn 4009/TCT-CS năm 2015

Công văn 4009/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn các Cục Thuế tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương và các doanh nghiệp thực hiện thống nhất quy định về việc kê khai, khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) phát sinh ở khâu nhập khẩu. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp tháo gỡ các vướng mắc thực tế của doanh nghiệp liên quan đến chứng từ nộp thuế và điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa nhập khẩu.

Các nội dung trọng tâm về kê khai và khấu trừ thuế GTGT khâu nhập khẩu

Văn bản tập trung làm rõ các nguyên tắc, điều kiện và thủ tục hồ sơ để doanh nghiệp được chấp thuận khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với hàng hóa nhập khẩu, cụ thể như sau:

• Điều kiện về chứng từ nộp thuế: Để được kê khai, khấu trừ thuế GTGT khâu nhập khẩu, doanh nghiệp bắt buộc phải có chứng từ nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu (như biên lai nộp thuế hoặc chứng từ nộp thuế vào ngân sách nhà nước). Chứng từ này phải thể hiện rõ số thuế GTGT đã nộp cho cơ quan hải quan.
• Điều kiện về chứng từ thanh toán: Doanh nghiệp phải đáp ứng điều kiện về chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa nhập khẩu theo quy định của pháp luật về thuế GTGT, trừ các trường hợp đặc biệt được miễn trừ theo quy định hiện hành.
• Xử lý đối với trường hợp ủy thác nhập khẩu: Trong giao dịch ủy thác nhập khẩu, bên nhận ủy thác có trách nhiệm nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu thay cho bên ủy thác. Khi bàn giao hàng hóa, bên nhận ủy thác phải lập hóa đơn GTGT hoặc chuyển giao chứng từ nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu để bên ủy thác làm căn cứ kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

Nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu bị trả lại hoặc tái xuất

Công văn cũng gián tiếp làm rõ nguyên tắc xử lý thuế GTGT trong các trường hợp phát sinh biến động sau khi hoàn tất thủ tục nhập khẩu:

• Trường hợp hàng hóa lỗi, hỏng phải xuất trả: Khi doanh nghiệp nhập khẩu hàng hóa, đã nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu nhưng sau đó phát hiện hàng hóa không đúng quy cách, chất lượng và phải xuất trả lại cho chủ hàng nước ngoài, việc xử lý hoàn thuế hoặc khấu trừ thuế phải tuân thủ đúng quy trình phối hợp giữa cơ quan Hải quan và cơ quan Thuế để tránh trùng lặp hoặc thất thoát ngân sách.
• Sự nhất quán trong kê khai: Số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu chỉ được kê khai, khấu trừ tại cơ quan thuế nội địa khi có sự trùng khớp về thông tin trên tờ khai hải quan, chứng từ nộp tiền vào ngân sách và sổ sách kế toán của doanh nghiệp.

Ý nghĩa và lưu ý áp dụng đối với doanh nghiệp

Việc nắm vững các hướng dẫn tại Công văn 4009/TCT-CS giúp doanh nghiệp chủ động trong việc chuẩn bị hồ sơ pháp lý, tránh các rủi ro bị xuất toán hoặc từ chối khấu trừ thuế GTGT đầu vào khi cơ quan thuế tiến hành thanh tra, kiểm tra. Doanh nghiệp cần lưu ý:

• Luôn lưu trữ đầy đủ, khoa học các tờ khai hải quan thông quan và chứng từ nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu bản gốc hoặc bản điện tử hợp pháp.
• Kiểm tra kỹ thông tin người nộp thuế trên chứng từ nộp tiền để đảm bảo khớp đúng với thông tin của doanh nghiệp thụ hưởng quyền khấu trừ thuế.
• Thực hiện thanh toán qua ngân hàng đúng hạn và đúng tài khoản của nhà cung cấp nước ngoài để bảo toàn điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào.