Công văn 4005/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành năm 2018 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ nhằm giải đáp các vướng mắc liên quan đến việc áp dụng thuế suất thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với mặt hàng trang thiết bị y tế. Đây là văn bản hướng dẫn quan trọng giúp các doanh nghiệp và cơ quan thuế địa phương thực hiện thống nhất quy định pháp luật về thuế.

Căn cứ pháp lý áp dụng thuế suất thuế GTGT

Tổng cục Thuế đưa ra hướng dẫn dựa trên hệ thống các văn bản quy phạm pháp luật về thuế GTGT hiện hành tại thời điểm ban hành, bao gồm:

• Luật Thuế giá trị gia tăng và các Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Nghị định của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Luật Thuế giá trị gia tăng.
• Thông tư số 26/2015/TT-BTC của Bộ Tài chính sửa đổi, bổ sung một số điều về thuế GTGT, trong đó có quy định cụ thể về thuế suất đối với thiết bị y tế chuyên dùng.
• Thông tư số 83/2014/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện thuế GTGT theo Danh mục hàng hóa nhập khẩu Việt Nam.

Quy định cụ thể về thuế suất thuế GTGT đối với thiết bị y tế

Theo nội dung hướng dẫn tại Công văn 4005/TCT-CS, việc xác định thuế suất thuế GTGT đối với trang thiết bị y tế được thực hiện dựa trên nguyên tắc phân loại và tính chất chuyên dùng của sản phẩm:

• Trường hợp áp dụng thuế suất 5%: Mức thuế suất ưu đãi 5% được áp dụng đối với các thiết bị, dụng cụ y tế chuyên dùng có giấy phép nhập khẩu hoặc giấy chứng nhận đăng ký lưu hành, hoặc văn bản xác nhận của Bộ Y tế theo quy định chuyên ngành. Các mặt hàng này bao gồm máy móc, dụng cụ chuyên dùng phục vụ cho việc khám bệnh, chữa bệnh, xét nghiệm, chiếu chụp, điều trị và các thiết bị y tế chuyên dùng khác theo danh mục quy định.
• Trường hợp áp dụng thuế suất 10%: Đối với các mặt hàng không thuộc danh mục thiết bị y tế chuyên dùng, hoặc không có đầy đủ giấy tờ xác nhận, chứng minh của Bộ Y tế theo quy định, hoặc là các thiết bị sử dụng đa năng (vừa dùng trong y tế vừa dùng cho mục đích tiêu dùng thông thường khác) thì phải áp dụng mức thuế suất thuế GTGT phổ thông là 10%.
• Lưu ý đối với linh kiện và bộ phận đi kèm: Các bộ phận, phụ tùng thay thế đi kèm với thiết bị y tế chuyên dùng cần được phân loại rõ ràng. Nếu là bộ phận đồng bộ nhập khẩu cùng thiết bị chính thì áp dụng theo thuế suất của thiết bị chính (5%). Trường hợp nhập khẩu rời hoặc không đồng bộ, cần căn cứ vào mã HS và bản chất hàng hóa thực tế để xác định thuế suất phù hợp.

Hướng dẫn tổ chức thực hiện cho doanh nghiệp và cơ quan thuế

Để đảm bảo việc áp dụng thuế suất đúng quy định, tránh thất thu ngân sách nhà nước cũng như hạn chế rủi ro pháp lý cho doanh nghiệp, Tổng cục Thuế yêu cầu:

• Các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực sản xuất, nhập khẩu và kinh doanh trang thiết bị y tế phải chủ động rà soát hồ sơ pháp lý của sản phẩm, chuẩn bị đầy đủ các giấy phép, xác nhận của Bộ Y tế để làm căn cứ áp dụng mức thuế suất ưu đãi 5% khi kê khai thuế.
• Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có trách nhiệm tuyên truyền, hướng dẫn và kiểm tra giám sát việc kê khai, nộp thuế của các doanh nghiệp trên địa bàn, đảm bảo tính thống nhất và đúng pháp luật.
• Trường hợp phát hiện doanh nghiệp áp dụng sai thuế suất (áp dụng mức 5% cho mặt hàng thuộc đối tượng chịu thuế 10%), cơ quan thuế sẽ thực hiện truy thu thuế và xử phạt vi phạm hành chính về thuế theo quy định của Luật Quản lý thuế.