Tóm tắt Công văn 3899/TCT-CS năm 2023 về thuế giá trị gia tăng

Công văn 3899/TCT-CS do Tổng cục Thuế ban hành nhằm hướng dẫn các Cục Thuế địa phương và doanh nghiệp thực hiện đúng các quy định về thuế giá trị gia tăng (GTGT), đặc biệt là chính sách hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp tháo gỡ các vướng mắc thực tế trong quá trình phân loại, kiểm tra và giải quyết hồ sơ hoàn thuế.

Căn cứ pháp lý áp dụng

Hướng dẫn tại Công văn dựa trên các văn bản quy phạm pháp luật hiện hành về thuế GTGT, bao gồm:

• Luật Thuế giá trị gia tăng số 13/2008/QH12 và các Luật sửa đổi, bổ sung (đặc biệt là Luật số 106/2016/QH13).
• Nghị định số 100/2016/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế GTGT.
• Thông tư số 219/2013/TT-BTC và Thông tư số 130/2016/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế GTGT và hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư.

Điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Tổng cục Thuế làm rõ các nguyên tắc và điều kiện để cơ sở kinh doanh được xét hoàn thuế GTGT trong giai đoạn đầu tư:

• Đối tượng áp dụng: Cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư hoặc cơ sở kinh doanh đang hoạt động có dự án đầu tư mới (bao gồm cả dự án đầu tư cùng tỉnh, thành phố hoặc khác tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính) đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động và chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký thuế.
• Ngưỡng trị giá hoàn thuế: Số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư lũy kế chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được xét hoàn thuế GTGT.
• Phương pháp kê khai: Doanh nghiệp phải thực hiện kê khai thuế GTGT riêng đối với dự án đầu tư và phải bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện (nếu có) trước khi xác định số thuế GTGT đầu vào được hoàn của dự án đầu tư.

Các trường hợp không được hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Công văn lưu ý cơ quan thuế không thực hiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư trong các trường hợp sau:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng chưa đáp ứng đủ điều kiện kinh doanh theo quy định của Luật Đầu tư (chưa được cấp giấy phép kinh doanh ngành nghề có điều kiện hoặc chưa đủ điều kiện thực hiện đầu tư kinh doanh có điều kiện).
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01/7/2016 hoặc dự án sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên theo dự án đầu tư.

Hướng dẫn tổ chức thực hiện cho cơ quan thuế địa phương

Để đảm bảo công tác quản lý thuế chặt chẽ và bảo vệ quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế, Tổng cục Thuế yêu cầu:

• Các Cục Thuế địa phương có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu kỹ hồ sơ pháp lý của dự án đầu tư, tiến độ góp vốn điều lệ, và việc đáp ứng các điều kiện về giấy phép đối với ngành nghề kinh doanh có điều kiện của doanh nghiệp.
• Quá trình giải quyết hồ sơ hoàn thuế phải được thực hiện đúng thời hạn, đúng quy trình nghiệp vụ. Trường hợp phát hiện dấu hiệu vi phạm hoặc có vướng mắc vượt thẩm quyền, Cục Thuế phải kịp thời báo cáo Tổng cục Thuế để được hướng dẫn xử lý thống nhất.