Công văn 3114/TCHQ-KTTT do Tổng cục Hải quan ban hành là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng nhằm thống nhất quy trình và tháo gỡ các vướng mắc liên quan đến việc đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế. Văn bản hướng dẫn chi tiết cho các Cục Hải quan tỉnh, thành phố và các doanh nghiệp thực hiện đúng quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và Nghị định số 134/2016/NĐ-CP.

Quy định về đối tượng và địa điểm đăng ký danh mục hàng hóa miễn thuế

Văn bản làm rõ các trường hợp bắt buộc phải thực hiện đăng ký danh mục hàng hóa nhập khẩu miễn thuế trước khi đăng ký tờ khai hải quan đầu tiên, cụ thể:

• Đối tượng áp dụng: Các dự án ưu đãi đầu tư, dự án sử dụng nguồn vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA), và các trường hợp khác được miễn thuế nhập khẩu theo quy định pháp luật cần phải xây dựng danh mục hàng hóa nhập khẩu tạo tài sản cố định hoặc phục vụ dự án.
• Địa điểm đăng ký: Người nộp thuế thực hiện đăng ký danh mục tại cơ quan hải quan nơi có dự án đầu tư, nơi đóng trụ sở chính của doanh nghiệp hoặc nơi có cơ sở sản xuất đối với các dự án không cố định địa điểm.
• Phương thức thực hiện: Việc đăng ký danh mục hàng hóa miễn thuế được thực hiện thông qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử của cơ quan hải quan (VNACCS/VCIS). Trường hợp hệ thống gặp sự cố kỹ thuật, người nộp thuế được phép nộp hồ sơ giấy trực tiếp tại chi cục hải quan có thẩm quyền.

Trách nhiệm của cơ quan hải quan trong tiếp nhận và xử lý hồ sơ

Tổng cục Hải quan yêu cầu các đơn vị hải quan địa phương nâng cao tinh thần trách nhiệm, đảm bảo tính chính xác và đúng đối tượng thụ hưởng chính sách ưu đãi:

• Kiểm tra tính hợp lệ của hồ sơ: Công chức hải quan có trách nhiệm đối chiếu danh mục hàng hóa đăng ký với mục tiêu, quy mô, công suất của dự án đầu tư đã được phê duyệt.
• Thời hạn xử lý: Cơ quan hải quan phải thực hiện tiếp nhận, kiểm tra và phản hồi kết quả cho doanh nghiệp trong thời hạn quy định, tránh gây chậm trễ làm ảnh hưởng đến tiến độ nhập khẩu thiết bị, máy móc của dự án.
• Phối hợp liên ngành: Trong trường hợp phát sinh nghi ngờ về tính chính xác của danh mục hoặc đối tượng ưu đãi, cơ quan hải quan nơi tiếp nhận hồ sơ cần chủ động phối hợp với các cơ quan quản lý chuyên ngành để xác minh thông tin trước khi phê duyệt.

Hướng dẫn sửa đổi, bổ sung danh mục và quản lý sau thông quan

Để đảm bảo công tác quản lý thuế được chặt chẽ từ khâu nhập khẩu đến khâu đưa vào sử dụng thực tế, văn bản đưa ra các chỉ đạo cụ thể:

• Sửa đổi, bổ sung danh mục: Người nộp thuế được quyền sửa đổi, bổ sung danh mục hàng hóa miễn thuế đã đăng ký nếu có sự thay đổi về thiết kế, quy mô dự án, nhưng phải thực hiện trước thời điểm nhập khẩu lô hàng có sự thay đổi đó.
• Báo cáo quyết toán sử dụng hàng hóa miễn thuế: Doanh nghiệp có nghĩa vụ báo cáo định kỳ về tình hình sử dụng hàng hóa nhập khẩu miễn thuế cho cơ quan hải quan nơi đăng ký danh mục để phục vụ công tác kiểm tra sau thông quan và phòng ngừa gian lận thương mại.