Công văn 2960/TCT-CS năm 2015 do Tổng cục Thuế ban hành nhằm giải quyết các vướng mắc liên quan đến chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT), trọng tâm là hướng dẫn điều kiện hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư trong trường hợp doanh nghiệp chưa góp đủ vốn điều lệ.

- Nguyên tắc khấu trừ và hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư mới

• Cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư đã đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động, nếu có thời gian đầu tư từ 01 năm trở lên thì được hoàn thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tư theo từng năm.
• Trường hợp số thuế GTGT lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tư lũy kế từ 300 triệu đồng trở lên thì được xem xét hoàn thuế GTGT theo quy định.

- Quy định về việc chưa góp đủ vốn điều lệ đối với dự án đầu tư

• Cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế GTGT mà phải chuyển số thuế chưa được khấu trừ của dự án đầu tư vào kỳ tiếp theo đối với trường hợp dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật.
• Quy định này nhằm đảm bảo tính tuân thủ pháp luật về doanh nghiệp, yêu cầu các đơn vị phải hoàn thành nghĩa vụ góp vốn theo đúng tiến độ đã cam kết trước khi thụ hưởng chính sách hoàn thuế từ ngân sách nhà nước.

- Hướng dẫn xử lý số thuế GTGT đầu vào chưa được hoàn

• Đối với số thuế GTGT đầu vào phát sinh của dự án đầu tư không được hoàn do nguyên nhân chưa góp đủ vốn điều lệ, doanh nghiệp thực hiện kê khai, kết chuyển để khấu trừ vào số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện.
• Doanh nghiệp cần chủ động rà soát, hoàn thiện việc góp vốn điều lệ theo đúng Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp hoặc Giấy chứng nhận đầu tư để đảm bảo đủ điều kiện xét hoàn thuế cho các kỳ tiếp theo.

- Trách nhiệm kiểm tra và thực thi của cơ quan thuế địa phương

• Tổng cục Thuế chỉ đạo Cục Thuế các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương căn cứ vào hồ sơ thực tế, chứng từ góp vốn và tình hình sản xuất kinh doanh của người nộp thuế để kiểm tra, đối chiếu chặt chẽ.
• Cơ quan thuế chỉ thực hiện giải quyết hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư khi người nộp thuế đáp ứng đầy đủ các điều kiện về khấu trừ, hoàn thuế và đã thực hiện góp đủ vốn điều lệ theo đúng quy định của pháp luật về doanh nghiệp và điều lệ của công ty.