Công văn 2296/TCT-KK được Tổng cục Thuế ban hành năm 2015 nhằm hướng dẫn các vướng mắc liên quan đến thủ tục hoàn thuế nhà thầu nước ngoài. Đây là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng giúp các cơ quan thuế địa phương và doanh nghiệp thống nhất phương án xử lý hồ sơ hoàn trả tiền thuế nộp thừa hoặc hoàn thuế theo Hiệp định tránh đánh thuế hai lần đối với các nhà thầu nước ngoài hoạt động kinh doanh tại Việt Nam.

- Đối tượng và điều kiện áp dụng hoàn thuế nhà thầu

Văn bản làm rõ các trường hợp nhà thầu nước ngoài được xem xét hoàn trả số thuế đã nộp vào ngân sách nhà nước, cụ thể bao gồm:

• Nhà thầu nước ngoài trực tiếp kê khai, nộp thuế nhà thầu tại Việt Nam và phát sinh số thuế nộp thừa so với số thuế thực tế phải nộp khi thực hiện quyết toán thuế hoặc khi kết thúc hợp đồng nhà thầu.
• Bên Việt Nam ký hợp đồng với nhà thầu nước ngoài, thực hiện khấu trừ và nộp thay thuế cho nhà thầu nước ngoài, nhưng sau đó phát sinh số thuế nộp thừa hoặc thuộc diện được miễn, giảm thuế theo quy định của Hiệp định tránh đánh thuế hai lần giữa Việt Nam và các quốc gia, vùng lãnh thổ liên quan.
• Các tổ chức, cá nhân nước ngoài có chứng từ nộp thuế hợp pháp, chứng minh được nghĩa vụ thuế đã hoàn thành và đáp ứng đầy đủ các điều kiện về hồ sơ pháp lý theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.

- Thẩm quyền và thủ tục nộp hồ sơ hoàn thuế

Công văn 2296/TCT-KK hướng dẫn chi tiết về việc xác định chủ thể nộp hồ sơ và cơ quan thuế có thẩm quyền tiếp nhận, giải quyết:

• Trường hợp nhà thầu nước ngoài ủy quyền cho Bên Việt Nam thực hiện thủ tục hoàn thuế: Bên Việt Nam (bên ký hợp đồng) có trách nhiệm chuẩn bị hồ sơ, kê khai và nộp hồ sơ hoàn thuế thay cho nhà thầu nước ngoài tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp của Bên Việt Nam.
• Trường hợp nhà thầu nước ngoài trực tiếp nộp hồ sơ: Nhà thầu nước ngoài hoặc đại diện hợp pháp được ủy quyền của nhà thầu tiến hành nộp hồ sơ hoàn thuế trực tiếp tại Cục Thuế nơi nhà thầu đăng ký thuế hoặc nơi phát sinh nghĩa vụ thuế nhà thầu.
• Hồ sơ hoàn thuế phải đảm bảo tính hợp pháp, hợp lệ theo quy định, bao gồm văn bản đề nghị hoàn thuế, hợp đồng nhà thầu, chứng từ nộp thuế vào ngân sách nhà nước và các tài liệu, giấy tờ chứng minh thuộc diện được hoàn thuế.

- Nguyên tắc xử lý tiền thuế nộp thừa và hoàn thuế theo Hiệp định

Tổng cục Thuế nhấn mạnh các nguyên tắc tài chính và nghiệp vụ đối với khoản thuế hoàn trả:

• Cơ quan thuế có trách nhiệm đối chiếu, kiểm tra tính chính xác của số thuế đã nộp trên hệ thống thông tin quản lý thuế trước khi ban hành quyết định hoàn thuế cho người nộp thuế.
• Đối với trường hợp hoàn thuế theo Hiệp định tránh đánh thuế hai lần, cơ quan thuế phải xem xét kỹ lưỡng các điều khoản về cơ sở thường trú, đối tượng cư trú và các loại thuế thuộc phạm vi áp dụng của Hiệp định để tránh việc hoàn thuế sai đối tượng hoặc trùng lặp.
• Khoản tiền thuế được hoàn trả sẽ được chuyển khoản trực tiếp vào tài khoản của nhà thầu nước ngoài hoặc tài khoản của Bên Việt Nam được ủy quyền hợp pháp theo đúng quy định về quản lý dòng tiền và thanh toán không dùng tiền mặt.

Công văn 2296/TCT-KK năm 2015 đóng vai trò là cơ sở hướng dẫn đồng bộ cho các cơ quan thuế địa phương và doanh nghiệp trong việc giải quyết các thủ tục hoàn thuế nhà thầu, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của nhà đầu tư nước ngoài đồng thời phòng chống thất thu ngân sách nhà nước.