Trả lời công văn số 501/INTHN-NHKD ngày 30/11/2006 của Công ty Cổ phần sản xuất và thương mại Intimex Hà Nội v/v xin hoàn thuế và xác nhận chưa khấu trừ thuế, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

Theo quy định tại điểm 2, mục II, phần A, Thông tư 120/2003/TT-BTC ngày 12/12/2003 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 158/2003/NĐ-CP ngày 10/12/2003 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật thuế giá trị gia tăng (GTGT) và Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật thuế GTGT, thì: Sản phẩm giống vật nuôi, cây trồng thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT là sản phẩm do các cơ sở nhập khẩu, kinh doanh thương mại có giấy đăng ký kinh doanh giống vật nuôi, cây trồng do cơ quan quản lý nhà nước cấp.

Trường hợp Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh số 0103011894 đăng ký lần đầu ngày 20/4/2006 và đã đăng ký thay đổi ngày 22/9/2006 của Công ty Cổ phần sản xuất và thương mại INTIMEX Hà Nội có các ngành hàng: nông, lâm, thủy, hải sản…(không ghi rõ giống vật nuôi, cây trồng) thì không được chấp nhận là kinh doanh giống vật nuôi, cây trồng để làm cơ sở xác định đối tượng không chịu thuế GTGT.

Tuy nhiên, căn cứ khoản 1, phần B Thông tư 115/2005/TT-BTC ngày 16/12/2005 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 156/2005/NĐ-CP ngày 15/12/2005 của Chính phủ sửa đổi, bổ sung các Nghị định quy định chi tiết thi hành Luật thuế tiêu thụ đặc biệt và Luật thuế GTGT, tại thời điểm công ty mở các tờ khai nhập khẩu thì mặt hàng củ giống hoa ly (củ huệ tây) do Công ty Cổ phần sản xuất và thương mại Intimex nhập khẩu thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

Trường hợp công ty đã nộp thuế GTGT thì không thực hiện hoàn trả do số thuế GTGT nộp ở khâu nhập khẩu sẽ được kê khai khấu trừ đầu vào khi xác định thuế GTGT phải nộp đầu ra theo như hướng dẫn tại công văn số 5578/TCHQ-KTTT ngày 16/11/2006 của Tổng cục Hải quan.

Tổng cục Hải quan thông báo để Công ty Cổ phần sản xuất và thương mại Intimex Hà Nội được biết và thực hiện.