Công văn 1062/TXNK-CST do Cục Thuế xuất nhập khẩu ban hành năm 2017 là văn bản hướng dẫn nghiệp vụ quan trọng liên quan đến việc hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu để sản xuất, kinh doanh nhưng sau đó đã đưa vào sản xuất sản phẩm xuất khẩu và thực tế đã xuất khẩu. Văn bản này giúp tháo gỡ các vướng mắc phát sinh trong quá trình thực hiện Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu số 107/2016/QH13 và Nghị định số 134/2016/NĐ-CP.

- Điều kiện để được hoàn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa sản xuất xuất khẩu

• Người nộp thuế đã nộp thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu, vật tư nhập khẩu để sản xuất, kinh doanh nhưng sau đó đã đưa vào sản xuất sản phẩm và đã xuất khẩu sản phẩm ra nước ngoài hoặc xuất khẩu vào khu phi thuế quan.
• Người nộp thuế phải có cơ sở sản xuất hàng hóa xuất khẩu trên lãnh thổ Việt Nam; có quyền sở hữu hoặc quyền sử dụng hợp pháp đối với máy móc, thiết bị tại cơ sở sản xuất phù hợp với nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất hàng hóa.
• Sản phẩm xuất khẩu phải được làm thủ tục hải quan theo đúng quy định. Quá trình sản xuất phải được theo dõi, phản ánh rõ ràng trên hệ thống sổ sách kế toán của doanh nghiệp.

- Nguyên tắc xác định số tiền thuế nhập khẩu được hoàn

• Số tiền thuế nhập khẩu được hoàn được tính toán dựa trên lượng nguyên liệu, vật tư nhập khẩu thực tế đã được sử dụng để sản xuất ra sản phẩm thực tế đã xuất khẩu.
• Trường hợp một loại nguyên liệu, vật tư nhập khẩu được sử dụng để sản xuất ra nhiều loại sản phẩm khác nhau nhưng doanh nghiệp chỉ xuất khẩu một phần sản phẩm, số tiền thuế được hoàn sẽ được phân bổ theo tỷ lệ giữa trị giá của sản phẩm xuất khẩu với tổng trị giá các sản phẩm thu được từ quá trình sản xuất.
• Doanh nghiệp có trách nhiệm tự xác định, kê khai chính xác định mức thực tế sử dụng nguyên liệu, vật tư để sản xuất sản phẩm xuất khẩu và chịu trách nhiệm trước pháp luật về tính chính xác của số liệu kê khai.

- Quy định về hồ sơ và thủ tục hoàn thuế

• Hồ sơ hoàn thuế phải được thực hiện theo đúng quy định tại Điều 36 Nghị định số 134/2016/NĐ-CP, bao gồm: Công văn yêu cầu hoàn thuế, chứng từ nộp thuế nhập khẩu, tờ khai hải quan hàng hóa nhập khẩu và xuất khẩu, hợp đồng xuất khẩu sản phẩm và báo cáo chi tiết về định mức thực tế sử dụng nguyên liệu.
• Cơ quan hải quan nơi tiếp nhận hồ sơ có trách nhiệm kiểm tra tính đầy đủ, hợp lệ của hồ sơ, đối chiếu thông tin trên hệ thống dữ liệu hải quan để thực hiện hoàn thuế hoặc không thu thuế nhập khẩu cho doanh nghiệp theo đúng quy định pháp luật, đảm bảo nhanh chóng và tránh gây phiền hà cho người nộp thuế.